Чтобы отключить автоматическую проверку диска при загрузке Windows, перейдите в следующий раздел реестра:

HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager

В правой панели дважды щелкните  по ключу BootExecute. Значение этого ключа по умолчанию – «autocheck autochk *»

* означает, что каждый диск проверяется на консистентность (целостность, согласованность). Просто добавьте параметр «/K:C» перед *. Параметр / K отключает автоматическую проверку диск C: при загрузке Windows. Итак, окончательное значение ключа реестра BootExecute должно выглядеть следующим образом:

autocheck autochk /k:C *

Если вы хотите отключить проверку и на других дисках (например на дисках C: и D: ), воспользуйтесь следующим ключом:

autocheck autochk /k:C /k:D *

Если вы захотите вернуть все обратно, просто замените значение параметра на:

autocheck autochk *

Update от 28.08.12

В том случае, если вы не нашли указанный ключ в реестре, отключить проверку диска при загрузке можно с помощью утилиты chkntfs (ключ /x). Для этого откройте командную строку с правами администратора и наберите команду:

chkntfs /x d: e:

После чего перезагрузите ПК. Указанная команда исключит диски D: и E: из процедуры автоматической проверки диска при загрузке. Если вам нужно исключить другие диски, просто измените команду, указав соответствующее имя диска.