1. В первую очередь такая проблема бывает из-за множества ошибок на жёстком диске, попробуйте применить в консоли восстановления команду CHKDSK С: /R, ошибки будут исправлены и возможно ваша система загрузится. Так же можно снять ваш жёсткий диск и подключить к другому системному блоку, затем из другой Windows проверить ваш системный раздел на ошибки, можете ознакомиться с полной статьёй о применении утилиты Chkdsk
2. Вы можете загрузиться с диска ERD Commander и попробовать применить восстановление системы. Кстати, диск системного администратора ERD Commander может выручить и в других сложных ситуациях, читайте полную статью об этом инструменте.
3. Ещё один способ. Если у вас было включено восстановление системы, тогда вам понадобится диск ERD Commander или любой Live CD. Смысл вот в чём. Все мы знаем, что в Windows XP хранит точки восстановления в папке System Volume Information\restore{E9F1FFFA-7940-4ABA-BEC6- 8E56211F48E2}\RP\snapshot, так вот, в папке выделенной красным хранятся неповреждённые файлы реестра. Нам нужно скопировать эти файлы и заменить ими повреждённые файлы реестра из папки C:\Windows\System32\Config
4. Последний вариант. Если восстановление системы у вас было отключено, тогда нужно заменить ваши повреждённые файлы реестра, файлами из папки С:\Windows\repair, в данной папке лежат резервные копии вашего реестра, созданные операционной системой при её установке, это можно сделать при помощи любого Live CD.
   
Теперь о каждом способе подробно.

Файл Windows\system32\config\system

Для реализации первого способа нам понадобится установочный диск Windows XP, загружаемся в консоль восстановления. Кто не знает как это сделать, может ознакомиться с нашей статьёй Консоль восстановления Windows XP. В консоли восстановления проверим наш системный диск (C:) на ошибки. В начале загрузки с установочного диска Windows XP, на экране появится надпись «Press any key to boot from CD…», нажимайте сразу любую клавишу, иначе надпись пройдёт в течении 10 секунд и загрузки с установочного Windows XP не произойдёт.

Что бы восстановить Windows XP с помощью консоли восстановления нажмите R

Введите пароль администратора. Вводим пароль администратора. Если пароля нет, значит жмите Enter на клавиатуре.
Когда в консоли восстановления Windows XP используют программу Chkdsk, то в основном применяют параметр /R, который включает в себя функции ещё одного параметра /P. Поэтому мы с вами будем использовать параметр /R
Вводим команду Chkdsk /r
и жмём Enter, происходит проверка жёсткого диска на ошибки.

Для реализации второго способа устранения ошибки Файл Windows\system32\config\system повреждён или отсутствует нужен диск ERD Commander, загружаемся с диска.
Жмём старт, далее системные инструменты System Tools->System Restore и выбираем восстановление системы. Выбираем точку восстановления системы и восстанавливаемся.

Третий способ.

Все мы знаем что в Windows XP хранит точки восстановления в папке

System Volume Information\restore{E9F1FFFA-7940-4ABA-BEC6- 8E56211F48E2}\RP\snapshot, так вот, в папке выделенной красным хранятся неповреждённые файлы реестра. Нам нужно скопировать эти файлы и заменить ими повреждённые файлы реестра из папки C:\Windows\System32\Config
  Загружаемся с диска ERD Commander или любого Live CD, если вы работаете с диска ERD Commander - не делаем подключения к системе, то есть, в начале загрузки диска ERD Commander выбираем (None), иначе вам не удастся заменить файлы реестра.

идём в папку C:\Windows\System32\Config. Открываем с помощью бегунка имя файла полностью и удаляем (Delete) повреждённые файлы реестра SAM, SEKURITY, SOFTWARE, DEFAULT, SYSTEM. Перед удалением их можно скопировать на всякий случай куда-нибудь, мало ли что.

REGISTRY_MACHINE_SAM
REGISTRY_MACHINE_SECURITY
REGISTRY _MACHINE\SOFTWARE
REGISTRY _MACHINE\DEFAULT
REGISTRY _MACHINE\SYSTEM

Теперь вставляем эти файлы на место удалённых в папку C:\Windows\System32\Config.
Выделяем папку C:\Windows\System32\Config и нажимаем ОК. Резервные файлы реестра копируются на место повреждённых. Затем заходим в папку Config и переименовываем их, удаляя лишнее - REGISTRY_MACHINE\, оставляя тем самым новые файлы реестра SAM, SEKURITY, SOFTWARE, DEFAULT, SYSTEM.

Четвёртый способ
Ещё можно заменить ваши повреждённые файлы реестра, файлами из папки С:\Windows\repair, в данной папке лежат резервные копии вашего реестра, созданные операционной системой при её установке, это можно сделать при помощи диска ERD Commander или любого Live CD. Но знайте, некоторые ваши приложения откажутся работать и их придётся переустановить, так как состояние системы будет приведено на момент установки.

затем идём в папку C:\Windows\System32\Config, выделяем её и нажимаем ОК.

Резервные файлы реестра заменяют повреждённые. Заменить файл? Соглашаемся- Yes